Google開源醫療AI工具DeepVariant部署於Google雲端. Google
由Google Brain與Verily Life Sciences打造, 用來提高基因組測序準確性的工具DeepVariant, 現在可以透過Google雲端平台(Google Cloud Platform; GCP)取得, 為DeepVariant的普及應用目標奠定基礎.
據Healthcare IT News報導, 開發團隊在Google雲端平台上部署開源版本的DeepVariant, 並採用可擴展的Pipelines API, 優化成本和達到快速周轉的目的. 為用戶在當前的運算環境中探索和評估DeepVariant的功能, 同時提供雲端解決方案, 滿足基因組龐大數據集的需求.
DeepVariant透過高通量測序的準確性, 解決精密醫學當前面臨的最大挑戰之一. 開發人員DePristo與Poplin表示, 30億堿基對基因組中只有100個基因, 每個堿基的錯誤率在0.1~10%之間, 所有配對的堿基被組織成23對染色體.
為了構建DeepVariant, Google Brain團隊首先從GIAB(Genome in a Bottle Consortium)組織的參考基因組開始, 建立數千萬個編碼高通量測序數據的示例. 下一步是培訓Google TensorFlow分類模型來區分真正的基因組和實驗數據.
2016年DeepVariant在美國食品藥品監督管理局(FDA)發起的PrecisionFDA Truth Challenge競賽中拿到第一名, 從那時起Google就將DeepVariant錯誤率降低50%以上.
微軟(Microsoft)與匹茲堡大學醫學中心合作發展人工智慧(AI)並發布新產品包括HealthVault Insights, Microsoft Genomics, 聊天機器人與Project InnerEye之後, 於2017年9月在英國成立專註醫療保健的人工智慧實驗室.
而IBM Watson自2015年收購Phytel和Explorys以來, 一直專註在醫療保健人工智慧, 並為超級計算機的產品組合添加華生基因體學方案Watson for Genomic和腫瘤解決方案Watson for Oncology.
Google的目標是將技術應用在醫療保線與其他科學應用上, 最終讓工具與數據提供給更多人使用. DeepVariant是利用Google的運算能力和機器學習來理解基因組, 並為社群提供更深入基於學習的基因組學工具.