Google开源医疗AI工具DeepVariant部署于Google云端. Google
由Google Brain与Verily Life Sciences打造, 用来提高基因组测序准确性的工具DeepVariant, 现在可以透过Google云端平台(Google Cloud Platform; GCP)取得, 为DeepVariant的普及应用目标奠定基础.
据Healthcare IT News报导, 开发团队在Google云端平台上部署开源版本的DeepVariant, 并采用可扩展的Pipelines API, 优化成本和达到快速周转的目的. 为用户在当前的运算环境中探索和评估DeepVariant的功能, 同时提供云端解决方案, 满足基因组庞大数据集的需求.
DeepVariant透过高通量测序的准确性, 解决精密医学当前面临的最大挑战之一. 开发人员DePristo与Poplin表示, 30亿碱基对基因组中只有100个基因, 每个碱基的错误率在0.1~10%之间, 所有配对的碱基被组织成23对染色体.
为了构建DeepVariant, Google Brain团队首先从GIAB(Genome in a Bottle Consortium)组织的参考基因组开始, 创建数千万个编码高通量测序数据的示例. 下一步是培训Google TensorFlow分类模型来区分真正的基因组和实验数据.
2016年DeepVariant在美国食品药品监督管理局(FDA)发起的PrecisionFDA Truth Challenge竞赛中拿到第一名, 从那时起Google就将DeepVariant错误率降低50%以上.
微软(Microsoft)与匹兹堡大学医学中心合作发展人工智能(AI)并发布新产品包括HealthVault Insights, Microsoft Genomics, 聊天机器人与Project InnerEye之后, 于2017年9月在英国成立专注医疗保健的人工智能实验室.
而IBM Watson自2015年收购Phytel和Explorys以来, 一直专注在医疗保健人工智能, 并为超级计算机的产品组合添加华生基因体学方案Watson for Genomic和肿瘤解决方案Watson for Oncology.
Google的目标是将技术应用在医疗保线与其他科学应用上, 最终让工具与数据提供给更多人使用. DeepVariant是利用Google的运算能力和机器学习来理解基因组, 并为社群提供更深入基于学习的基因组学工具.