Según el sitio web de tecnología de Estados Unidos Ars Technica, las 4 bases de ADN (A, C, G, T) pueden cambiar las corrientes y voltajes en ambos lados del nanoporo de diferentes maneras y midiendo el cambio en corriente y voltaje, respectivamente Para la secuenciación de ADN monocatenario.
Seis años después, los investigadores están encontrando nuevos usos para el secuenciador centrándose en las propiedades de estos nanoporos proteicos. En un artículo reciente publicado en la revista Nature Biotechnology, investigadores de la Universidad introdujeron leen largo longitudes (lectura larga) se proporciona el dispositivo de secuenciación, y cómo se usa para secuenciar el genoma humano resisten caracterizado previamente. el dispositivo también puede usarse para determinar los otros dos genes de Cromosomas, que mapean las regiones epigenéticamente controladas de todo el genoma.
El propósito de este nuevo instrumento de secuenciación de la Universidad de Birmingham, en el Reino Unido (Universidad de Birmingham), Profesor del Instituto de Microbiología e Infección Nick Loman y el estudiante graduado de doctorado Josh rápida desarrollado conjuntamente. Juego rápido un papel importante en el desarrollo del método de lectura de largo.
Aunque el secuenciador sigue siendo propenso a errores, supera al secuenciador más preciso cuando se producen errores, especialmente cuando se lee ADN con más de 200 bases. Cuando el ADN se repite, el otro Programas de software, y cuando se usa un dispositivo de alta precisión con un pequeño dispositivo de Oxford Nanopore, ofrece un compromiso entre secuencias y muestra cómo la secuencia puede formar una parte más grande.
Usando diferentes soluciones de software e datos de interpretación de datos de voltaje, el estudio exploró varias maneras de generar la mejor secuencia de nanoporos. Los investigadores realizaron múltiples lecturas y trazados en una variedad de formas, logrando en última instancia un 99.44% de precisión. .
Ars Technica informa que debido a que heredamos los dos cromosomas duplicados de nuestros padres, respectivamente, aunque el ADN subyacente es el mismo a pesar de las diferentes versiones, esto significa que el ADN corto y largo no determina la diferencia entre los dos, La larga lectura proporcionada por el nanoporo fue de la mayor importancia, y durante el transcurso del experimento, los investigadores encontraron que su longitud de lectura era tan alta como 882,000 bases, lo que no fue posible con el proyecto original de secuenciación del genoma y los investigadores predijeron que La nueva aplicación ayudará a llenar todas las vacantes en el proyecto original del genoma.
Los investigadores encontraron algunos desafíos durante el estudio, ya que descubrieron que la especificación genérica de archivos utilizada para guardar datos de ADN no podía manejar secuencias largas que llevaban a la falla del software de análisis. Por supuesto, si el software podría actualizarse para incluir esta funcionalidad, Entonces la posibilidad de futuras aplicaciones es interminable.
Loman dijo: "Incluso hace un año, era prácticamente imposible secuenciar todo el genoma humano, pero con los recientes avances e innovaciones en la tecnología nanopore, ahora hemos podido secuenciar segmentos genómicos muy largos. También comparó este método de secuenciación con un rompecabezas.
"Uno de los hallazgos más importantes de este estudio es que, incluso después de completar una referencia del genoma humano o pensar que se ha realizado durante algún tiempo, todavía contiene muchas deficiencias y el nuevo método que desarrollamos se desarrolló utilizando la secuenciación de nanoporos. Fuera de la longitud de lectura larga, acortando así la secuencia de algunos huecos.
Compilar: Susan Hong