Согласно веб-сайту технологии Ars Technica, 4 базы ДНК (A, C, G, T) могут по-разному изменять токи и напряжения по обе стороны нанопоры, измеряя изменение тока и напряжения Для одноцепочечного секвенирования ДНК.
Шесть лет спустя исследователи находят новое применение для секвенсора, сосредотачиваясь на свойствах этих белковых нанопор. В недавней публикации, опубликованной в журнале Nature Biotechnology, Бирмингем, Англия Исследователи из университета представили давно прочитанное, что предоставил секвенсер и как он использовался для последовательности генома человека, который ранее был устойчив к характеристике. Устройство также могло быть использовано для принятия решения о двух чтениях из другого гена Хромосомы, которые отображают эпигенетически контролируемые области всего генома.
Новое использование секвенсора было разработано Ником Ломаном, профессором Института микробиологии и инфекционных болезней в Бирмингемском университете, и Джошем Бэком, аспирантом в Бирмингемском университете, где Quick играет важную роль в разработке метода читателя в законе.
Хотя секвенсор все еще подвержен ошибкам, он превосходит более точный секвенсор при возникновении ошибок, особенно при чтении ДНК с более чем 200 основами. Когда ДНК повторяется, другая Программные программы, и когда высокоточное устройство используется с небольшим устройством из Oxford Nanopore, оно предлагает компромисс между последовательностями и показывает, как последовательность может составлять большую часть.
Используя различные программные решения и данные интерпретации данных о напряжении, в исследовании были исследованы несколько способов создания наилучшего нанопористого секвенирования. Исследователи выполнили множественные считывания и графики различными способами, в конечном итоге достигли точности 99,44% ,
Ars Technica сообщает, что, поскольку мы наследуем две повторяющиеся хромосомы от наших родителей, соответственно, хотя базовая ДНК одинакова, несмотря на разные версии, это означает, что короткая длинная ДНК не определяет разницу между этими двумя, Длительное считывание, полученное нанопором, имело первостепенное значение, и в ходе эксперимента исследователи обнаружили, что его длина считывания достигла 882 000 оснований, что было невозможно с первоначальным проектом секвенирования генома, и исследователи предсказывали, что Новое приложение поможет заполнить все вакансии в оригинальном проекте генома.
Исследователи столкнулись с некоторыми проблемами во время исследования, поскольку обнаружили, что общая спецификация файлов, используемая для сохранения данных ДНК, не справилась с длинными последовательностями, которые привели к сбою программного обеспечения для анализа. Конечно, если бы программное обеспечение могло быть обновлено, чтобы включить эту функциональность, Тогда возможность будущих приложений бесконечна.
Ломан сказал: «Даже год назад практически невозможно было упорядочить весь человеческий геном, но с недавними достижениями и нововведениями в технологии нанопоры нам удалось упорядочить очень длинные геномные сегменты Он также сравнил этот метод секвенирования с головоломкой.
«Одним из наиболее важных результатов в этом исследовании является то, что даже после завершения ссылки на человеческий геном или мышления, которое оно было сделано в течение некоторого времени, оно все еще содержит много недостатков и новый метод, который мы разработали с использованием нанопорирования Из длинной длины считывания, тем самым сокращая последовательность некоторых зазоров.
Компиляция: Сьюзан Хонг