米国の技術ウェブサイトArs Technicaによると、DNA(A、C、G、T)の4つの塩基は、電流および電圧の変化を測定することによって、ナノポアの両側の電流および電圧を様々な方法で変化させることができる一本鎖DNA配列決定のため。
6年後、原因これらの懸念タンパク質ナノ細孔の性質の研究者は、シーケンシング機器の新しい使い方を発見した。最近、「ネイチャー・バイオテクノロジー」(ネイチャー・バイオテクノロジー)ジャーナル紙、バーミンガム、英国で出版されて大学の研究者長いリード長を導入し(長いリード)配列決定装置が提供され、そしてそれはヒトゲノムを配列決定するために使用される方法を以前に特徴付けレジストデバイスから他の二つの遺伝子を決定するためにも使用することができます染色体のセットは、遺伝子制御領域は見かけ上の全ゲノムの位置です。
共同開発バーミンガム英国の大学(バーミンガム大学)教授、微生物学研究所感染ニックLomanおよび博士課程の大学院生ジョシュクイックすることにより、この新しいシーケンス楽器の目的。クイックプレイ長い読み取り方法の開発に重要な役割。
シーケンサーは依然としてエラーを起こしやすいですが、エラーが発生したとき、特に200塩基以上のDNAを読み取るときに、より正確なシーケンサーより優れています。ソフトウェアプログラムであり、オックスフォードナノポアの小型デバイスで高精度のデバイスを使用する場合、シーケンス間の妥協点を示し、シーケンスがどのように大きな部分を形成するかを示します。
さまざまなソフトウェアソリューションと電圧データ解釈データを使用して、この研究は最良のナノアレイ配列を生成するいくつかの方法を検討しました。研究者はさまざまな方法で複数の読み込みとプロットを行い、最終的に99.44% 。
我々は、各親からの染色体の2つのコピーを継承するのでアルステクニカレポートは、説明 - 異なるバージョンにもかかわらず、しかし、根底にあるDNAは意味し、同じである二つのた原因を特定することができないDNAの短いリード長。長い決定的なナノ細孔が提供するお読みください。実験中、研究者は読み取りが達成できない最初のゲノム配列決定プログラムである882000個の塩基、までの長さのことがわかった。研究者は、このことを予測します新しいアプリケーションは、元のゲノムプロジェクトのすべての欠員を埋めるのに役立ちます。
研究の間、研究者はまた、いくつかの課題に直面しました。彼らは、ソフトウェア障害が生じ、DNAデータの仕様を格納するための一般的なファイルの長いシーケンスを処理できないことがわかった。もちろん、ソフトウェアは、この機能を含むように更新することができれば、将来のアプリケーションの可能性は無限です。
Lomanは言った。「でも、一年前に、実際には、ヒトゲノム全体の塩基配列決定を行うことが困難であるが、そのようなナノホールなどの最近の進歩と革新的な技術のおかげで、我々は今、ゲノム断片の非常に長いシーケンシングすることができます彼はまた、このシークエンシング方法をパズルに比較しました。
この研究で最も重要な発見の1つは、ヒトゲノムの参照を完了した後も、それがしばらく行われたと考えても、それにはまだ多くの欠点があり、我々が開発した新しい方法はナノポア配列決定長い読み取り長さから、いくつかのギャップのシーケンスを短縮します。
コンパイル:香港のスーザン