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लंबे पढ़ने की लंबाई प्रदान करने के लिए पोर्टेबल डीएनए सीक्वेंसर

एक पोर्टेबल डीएनए सीक्वेंसर कंपनी, ऑक्सफ़ोर्ड नैनोपोर टेक्नोलॉजीज ने एक यूएसबी सीक्वेंसर को 2012 में ठेठ यूएसबी थंब ड्राइव के समान जारी किया, जिसमें कार्ड के डेक की तुलना में एक छोटे पदचिह्न था, और अभिनव होने के बावजूद भी कई मुद्दों पर - - थोड़ी देर में देरी भी शामिल है, और कभी-कभी ऐसा सटीक नहीं होता है, सीक्वेंसर डबल-फलक से एकल-फंसे डीएनए लेता है और प्रोटीन पियर्स के माध्यम से छोटी मात्रा में वर्तमान देता है।

यू.एस. टेक्नोलॉजी वेबसाइट एआरएस टेक्नीका के मुताबिक डीएनए (ए, सी, जी, टी) के चार ठिकानों नैनोपोर के दोनों तरफ धाराओं और वोल्ट्स को अलग-अलग तरीकों से बदल सकते हैं, जो वर्तमान और वोल्टेज में परिवर्तन को माप कर एकल फंसे डीएनए अनुक्रमण के लिए

छह साल बाद, इन चिंताओं प्रोटीन nanopore की प्रकृति के कारण शोधकर्ताओं अनुक्रमण साधन का एक नया प्रयोग पाया। हाल ही में "प्रकृति जैव प्रौद्योगिकी" (प्रकृति जैव प्रौद्योगिकी) पत्रिका कागज, बर्मिंघम ब्रिटेन में प्रकाशित विश्वविद्यालय में शोधकर्ताओं ने लंबे समय तक लंबाई पढ़ पेश किया (लंबी पढ़ें) अनुक्रमण उपकरण प्रदान की जाती है, और यह कैसे मानव जीनोम उन्हें क्रमबद्ध पहले से विशेषता विरोध के लिए प्रयोग किया जाता है। डिवाइस भी से अन्य दो जीन निर्धारित करने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता गुणसूत्रों के सेट, आनुवंशिक नियंत्रण क्षेत्र एक स्पष्ट पूरे जीनोम स्थिति है।

ब्रिटेन में बर्मिंघम विश्वविद्यालय (बर्मिंघम विश्वविद्यालय), प्रोफेसर, संस्थान माइक्रोबायोलॉजी और संक्रमण निक Loman और डॉक्टरेट स्नातक छात्र जोश त्वरित द्वारा इस नए अनुक्रमण साधन के प्रयोजन के लिए संयुक्त रूप से लंबे समय तक पढ़ने विधि के विकास में एक महत्वपूर्ण भूमिका का विकास किया। त्वरित खेलते हैं।

हालांकि सीक्वेंसर अभी भी त्रुटि प्रवण है, यह त्रुटि के कारण अधिक सटीक सीक्वेलर को मात देता है, खासकर जब 200 से अधिक बेस के साथ डीएनए पढ़ना। जब डीएनए दोहराया जाता है, दूसरा सॉफ्टवेयर प्रोग्राम, और जब ऑक्सफोर्ड नैनोपोर से एक छोटा उपकरण के साथ एक अति सटीक डिवाइस का प्रयोग किया जाता है, तो यह दृश्यों के बीच एक समझौता प्रदान करता है और दिखाता है कि अनुक्रम एक बड़ा हिस्सा कैसे बना सकता है।

विभिन्न सॉफ़्टवेयर समाधानों और वोल्टेज डेटा व्याख्या डेटा का उपयोग करके, अध्ययन ने सर्वोत्तम नैनोपोरे अनुक्रमण उत्पन्न करने के कई तरीकों का पता लगाया। शोधकर्ताओं ने कई तरीकों से कई पाठों और भूखंडों का प्रदर्शन किया, अंत में 99.44% शुद्धता प्राप्त कर ली ।

एर्स टेक्नीका की रिपोर्ट है कि क्योंकि हम क्रमशः हमारे माता-पिता से दो दोहराए हुए गुणसूत्रों का उत्तराधिकारी बनाते हैं, हालांकि, विभिन्न संस्करणों के बावजूद अंतर्निहित डीएनए समान है, इसका मतलब है कि लघु, लंबे डीएनए दोनों के बीच का अंतर निर्धारित नहीं करता है, नैनोपोर द्वारा प्रदान किए जाने वाले लंबे समय तक पढ़ा जाने वाला सबसे महत्त्व सबसे महत्वपूर्ण था, और प्रयोग के दौरान, शोधकर्ताओं ने पाया कि इसकी रीडिंग लंबाई 882,000 कुर्सियां ​​जितनी अधिक थी, जो मूल जीनोम अनुक्रमण परियोजना के साथ संभव नहीं थी और शोधकर्ताओं ने अनुमान लगाया कि नया आवेदन मूल जीनोम परियोजना में सभी रिक्तियों को भरने में मदद करेगा।

अध्ययन के दौरान शोधकर्ताओं ने यह भी कुछ चुनौतियों बेशक, अगर सॉफ्टवेयर इस सुविधा शामिल करने के लिए अद्यतन किया जा सकता का सामना करना पड़ा था। उन्होंने पाया कि डीएनए डेटा विनिर्देशों के भंडारण के लिए आम फ़ाइल की लंबी अनुक्रम संसाधित नहीं किया जा सकता है, सॉफ्टवेयर विफलता में जिसके परिणामस्वरूप।, तो भविष्य आवेदन संभावनाएं अनंत हैं।

Loman ने कहा: 'यहां तक ​​कि एक साल पहले, वास्तव में, यह मुश्किल पूरे मानव जीनोम का अनुक्रमण बाहर ले जाने के लिए है, लेकिन हाल के अग्रिमों और इस तरह के नैनो-छेद के रूप में नवीन तकनीकों के लिए धन्यवाद, अब हम जीनोमिक टुकड़ा का बहुत लंबे अनुक्रमण करने में सक्षम हैं 'वह भी अनुक्रमण पहेली के लिए इस विधि की तुलना।

"इस अध्ययन में सबसे महत्वपूर्ण निष्कर्ष यह है कि मानव जीनोम संदर्भ को पूरा करने या सोचने के बाद भी यह कुछ समय के लिए किया गया है, इसमें अभी भी कई कमियां हैं और नैनोपोरे अनुक्रमण लंबे पढ़ने की लंबाई से, इस प्रकार कुछ अंतराल के अनुक्रम को छोटा करना।

संकलन: सुसान हांग

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