Selon le site de technologie américaine Ars Technica, les 4 bases d'ADN (A, C, G, T) peuvent changer les courants et les tensions des deux côtés du nanopore de différentes manières et en mesurant les changements de courant et de tension, respectivement Pour le séquençage d'ADN simple brin.
Six ans plus tard, les chercheurs en raison de la nature de ces préoccupations nanopore des protéines ont trouvé une nouvelle utilisation de l'instrument de séquençage. Dans le récemment publié dans « Nature Biotechnology » (Nature Biotechnology) Papier journal, Birmingham au Royaume-Uni chercheurs de l'Université ont introduit des longueurs de temps lues (lecture longue) du dispositif de séquencement est fourni, et la façon dont il est utilisé pour le séquençage du génome humain résistent précédemment caractérisé. le dispositif peut également être utilisé pour déterminer les deux autres gènes de ensembles de chromosomes, la région de contrôle génétique est un ensemble de ressort de positionnement du génome.
Le but de ce nouvel instrument de séquençage par l'Université de Birmingham au Royaume-Uni (Université de Birmingham), Professeur, Institut de microbiologie et maladies infectieuses Nick Loman et étudiant diplômé au doctorat jeu rapide Josh rapide développé conjointement. Un rôle important dans le développement de la méthode de lecture longue.
Bien que ce dispositif est toujours facile à des erreurs de séquençage, mais par rapport au dispositif séquenceur ayant une erreur de haute précision Shique supérieure, en particulier lorsqu'il est lu avec plus de 200 bases d'ADN. Lorsque l'ADN répétitif, autre le logiciel également d'autres accidents. et quand le petit appareil de l'appareil très précis avec Oxford Nanopore utiliser, peuvent fournir un compromis pour mettre en œuvre une séquence, et montre comment former une plus grande partie de la séquence.
L'étude des différentes solutions logicielles et l'interprétation des données de tension de données, d'explorer plusieurs façons de produire le meilleur séquençage nanopore les chercheurs ont comploté pour lire multiples et diverses façons, en fin de compte atteindre une précision de 99,44% .
Ars rapports Technica expliquent, puisque nous avons hérité de deux copies du chromosome de chaque parent - malgré les différentes versions, mais l'ADN sous-jacent est le même, ce qui signifie que de courtes longueurs de lecture de l'ADN donc pas en mesure de déterminer pourquoi les deux étaient. longue lecture fournissent nanopore crucial. au cours des expériences, les chercheurs ont constaté que la lecture des longueurs jusqu'à 882.000 bases, ce qui est dans le programme de séquençage du génome initial ne peut être atteint. les chercheurs prédisent que cette La nouvelle application aidera à combler tous les postes vacants dans le projet original du génome.
Au cours de l'étude, les chercheurs ont également rencontré quelques difficultés. Ils ont constaté que longue séquence de fichier commun pour stocker les spécifications de données d'ADN ne peut pas être traitée, entraînant une défaillance du logiciel. Bien sûr, si le logiciel peut être mis à jour pour inclure cette fonctionnalité, alors les possibilités d'application futures sont infinies.
Loman a déclaré: « Même il y a un an, en fait, il est difficile de réaliser le séquençage du génome humain, mais grâce aux progrès récents et des technologies innovantes telles que les nano-trous, nous sommes maintenant en mesure de très long séquençage du fragment génomique « il a également comparé cette méthode pour casse-tête de séquençage.
"L'une des conclusions les plus importantes de cette étude est que même après avoir complété une référence du génome humain ou pensé qu'elle a été faite pendant un certain temps, elle contient encore de nombreuses déficiences et la nouvelle méthode développée en utilisant le séquençage nanopore En cas de longueur de lecture longue, raccourcissant ainsi la séquence de certaines lacunes.
Compiler: Susan Hong