أخبار

المحمولة دنا المنظم لتوفير طول قراءة طويلة

المحمولة DNA شركة تسلسل الصك أكسفورد ثقب النانو تكنولوجيا، التي نشرت في عام 2012، والتسلسل USB يعني يعادل الحجم العام من محرك أقراص فلاش USB، التي هي أصغر من مجموعة أوراق اللعب رغم مبتكرة، ولكن هناك العديد من المشاكل - - بما في ذلك تأخر قليلا، والتسلسل في بعض الأحيان أقل دقة من الصك يمكن إجراء DNA واحد الذين تقطعت بهم السبل من المزدوج تقطعت بهم السبل بنية لولبية، وينتقل كمية صغيرة من التيار عبر المسام البروتين.

أبلغت الولايات المتحدة التكنولوجيا موقع آرس تكنيكا، 4 قواعد (A، C، G، T) DNA من كلا التيار والجهد يمكن تغيير بطرق مختلفة ثقب النانو من خلال تغيير في قياس التيار والجهد، على التوالي، يمكن أن يكون لتسلسل واحد الذين تقطعت بهم السبل لDNA.

بعد ست سنوات، وجد الباحثون نظرا لطبيعة هذه المخاوف البروتين ثقب النانو استخدام جديد للأداة التسلسل. ونشرت مؤخرا في "التكنولوجيا الحيوية للطبيعة" (التكنولوجيا الحيوية للطبيعة) ورقة مجلة، برمنغهام في المملكة المتحدة باحثون في جامعة وعرض قراءة طويلة أطوال (طويل قراءة) يتم توفير جهاز التسلسل، وكيف يتم استخدامه لتسلسل الجينوم البشري مقاومة تتميز سابقا. كما يمكن استخدام الجهاز لتحديد اثنين من الجينات الأخرى من مجموعات من الصبغيات (الكروموسومات)، والمنطقة التحكم الجيني هو واضح كامل المواقع الجينوم.

والغرض من هذا الصك تسلسل جديد من جامعة برمنغهام في المملكة المتحدة (جامعة برمنجهام)، أستاذ في معهد علم الأحياء الدقيقة والعدوى نيك لومان والدكتوراه طلاب الدراسات العليا جوش السريع وضعت بالاشتراك. اللعب السريع دورا هاما في تطوير طريقة قراءة طويلة.

على الرغم من أن المنظم لا يزال عرضة للخطأ، فإنه يتفوق على التسلسل أكثر دقة عند حدوث أخطاء، وخصوصا عند قراءة الحمض النووي مع أكثر من 200 قواعد.عندما يتكرر الحمض النووي، والآخر برامج البرمجيات، وعندما يتم استخدام جهاز دقيق للغاية مع جهاز صغير من أكسفورد نانوبور، فإنه يقدم حلا وسطا بين تسلسل ويظهر كيف يمكن أن تشكل تسلسل جزء أكبر.

وباستخدام حلول البرمجيات المختلفة وبيانات تفسير البيانات الجهد، واستكشفت الدراسة عدة طرق لتوليد أفضل تسلسل نانوبور.أجرى الباحثون قراءة متعددة والمؤامرات في مجموعة متنوعة من الطرق، وتحقيق في نهاية المطاف دقة 99.44٪ .

وتفيد تقارير آرس تيشنيكا أنه نظرا لأننا نرث الكروموسومات المزدوجة من والدينا على التوالي، على الرغم من أن الحمض النووي الأساسي هو نفسه على الرغم من الإصدارات المختلفة، وهذا يعني أن الحمض النووي القصير والطويل لا يحدد الفرق بين الاثنين، كانت القراءة الطويلة التي يوفرها نانوبور ذات أهمية قصوى، وخلال التجربة، وجد الباحثون أن طول القراءة كان يصل إلى 882،000 قواعد، وهو أمر لم يكن ممكنا مع مشروع تسلسل الجينوم الأصلي وتوقع الباحثون أن سوف يساعد التطبيق الجديد ملء جميع الشواغر في مشروع الجينوم الأصلي.

وقد واجه الباحثون بعض التحديات أثناء الدراسة حيث وجدوا أن مواصفات الملف العامة المستخدمة لحفظ بيانات الحمض النووي لا يمكن التعامل مع تسلسل طويلة أدت إلى فشل برنامج التحليل.وبطبيعة الحال، إذا كان يمكن تحديث البرنامج ليشمل هذه الوظيفة، ثم إمكانية التطبيقات المستقبلية لا حصر لها.

وقال لومان: "حتى قبل عام، كان من المستحيل تقريبا تسلسل الجينوم البشري بأكمله، ولكن مع التطورات والابتكارات الأخيرة في تكنولوجيا نانوبور، ونحن الآن قادرة على تسلسل شرائح الجينوم طويلة جدا كما قارن هذا الأسلوب التسلسل إلى لغز.

"واحدة من أهم النتائج في هذه الدراسة أنه حتى بعد الانتهاء من مرجع الجينوم البشري أو التفكير أنه تم القيام به لبعض الوقت، فإنه لا يزال يحتوي على العديد من أوجه القصور والطريقة الجديدة التي وضعناها وضعت باستخدام تسلسل نانوبور من طول قراءة طويلة، وبالتالي تقصير تسلسل بعض الثغرات.

ترجمة: سوزان هونغ

2016 GoodChinaBrand | ICP: 12011751 | China Exports