Primer programa de aceleración FPGA secuenciación genética de segunda generación de China aterrizaje Tencent nube

BEIJING, 25 de dic (Xinhua): Con el rápido desarrollo de la tecnología de secuenciación de genes para generar los datos genéticos que muestran un crecimiento exponencial, mayores exigencias a las capacidades analíticas Recientemente, Tencent nube lanzó oficialmente el primer basado en FPGA Aurora tecnología de desarrollo propio de China. El programa de aceleración NGS para mejorar en gran medida la eficiencia del análisis del genoma humano y mejorar de manera efectiva el campo del análisis de datos genéticos es lento, ineficiente, etc.

Nube de Tencent totalmente habilitada para mejorar el campo de los problemas genéticos

Como una nueva tecnología de secuenciación genética de las pruebas genéticas, juega un papel importante en la investigación en ciencias biológicas, generado una industria próspera del crecimiento explosivo de datos bio-genética, por lo que la compañía del gen, los científicos y otros nuevos retos. recientemente, Tencent dijo que abrirá completamente las capacidades de TI en la nube, en términos de transporte, el almacenamiento, la informática, la gestión y la penetración en otras áreas de ayuda biogenética desarrollo integral y rápida.

En primer lugar, el valor nominal de los problemas de transmisión de datos genéticos, Tencent nube de construir la línea 28 entorno más completa red BGP que permite a los clientes rápidamente y de forma estable los datos de carga y descarga de genes, mientras que ayuda a los clientes a hacer negocios nube en los datos de genes, a través de una clave distribución de la función de genes permite a las empresas para pasar datos a los usuarios científicos. en segundo lugar, proporcionando Tencent almacenamiento de archivos en la nube, almacenamiento de objetos y el almacenamiento de archivos y otros servicios de almacenamiento para satisfacer a los clientes se enfrentan a diferentes campos de escenarios de uso de datos de genes y requisitos, y para el núcleo Computing, Tencent Cloud ofrece servicios de súper nube que permiten a los investigadores y fabricantes de genes seleccionar una amplia gama de máquinas virtuales de alto rendimiento y máquinas físicas para acelerar los cálculos de genes.

Además, Tencent industria genes nube desarrollado especialmente plataforma de gestión de datos integrado 'doble hélice plataforma PAAS Tencent nube', para cumplir con la transferencia de genes a los usuarios, el almacenamiento, cálculo, tubería y otras necesidades. Se entiende que la plataforma Tencent nube tiene una doble hélice tres características. la primera es el análisis rápido de análisis genético para acelerar el proceso mediante el FPGA en la doble hélice, para la secuenciación de segunda generación, que ya se puede ahorrar el 90% del tiempo, el seguimiento continuará para acelerar la introducción de tres generaciones de servicio, seguido de ahorro de costes, basándose en capacidades de programación precisas de la doble hélice, doble hélice se programará durante los cálculos necesarios para llevar a cabo el grupo de trabajo considera el mejor partido para evitar una gran cantidad de CPU o la memoria, la situación no transporte. la tercera es la tecnología que permite la inteligencia artificial ha sido preciso en el campo de la medicina suelo. por ejemplo, en la provincia de Guangdong, AI Tencent buscan ayudar a los médicos hacen sombra en el cribado para el cáncer esofágico inicial, examinar el impacto de una endoscopia, buscar la sombra AI puede hacer un diagnóstico dentro de 4 segundos, la tasa de precisión del 90%.

PAAS Internet Tencent esquemática características de doble hélice

NGS acelerar los programas para mejorar el análisis de todo el genoma humano de la eficiencia y la precisión de los análisis

Tencent ha lanzado recientemente equipo de gen basado en la nube desde la investigación FPGA Aurora sistemas heterogéneos NGS programa acelerado, se puede optimizar todo el análisis del genoma humano a partir de 30 horas a 2,8 horas. Durante el experimento, los investigadores utilizaron una profundidad de secuenciación de 30 veces la humana archivo genoma FASTQ (NA12878), son comunes en la industria en general está montado en el servidor de alto rendimiento y el sistema de servidor son heterogéneos prueba de comparación FPGA Aurora, los datos experimentales muestran que el programa de aceleración Tencent NGS más de 10 veces la relación de la aceleración.

sistemas informáticos tradicionales y heterogénea comparación sistemas Tencent Aurora

Se entiende que los sistemas informáticos tradicionales para lograr el propósito de acortar el tiempo para construir mediante el uso de sistemas de CPU HPC más de gama alta, pero también hace que el aumento de los costos, tamaño de la empresa gen es limitado. Sistemas heterogéneos Tencent Aurora mientras que proporciona un rendimiento superior, sino también gen se puede reducir aún más los costes de los clientes, que utiliza tecnología de la base de desarrollo propio Aurora (Aurora tecnología), optimización de análisis convencional y el cálculo por los tres procesos siguientes integralmente.

El líder en la industria de tecnología de diseño en primer lugar, la realización y la variante BWA_MEM Calling núcleo algoritmo de hardware dedicado. LSI, el rendimiento de los algoritmos a un nuevo nivel.

En segundo lugar, el algoritmo de optimización a nivel de modo de acceso a la memoria.

En tercer lugar, los cuellos de botella IO resultantes en el rendimiento del sistema no pueden mejorarse ha sido un análisis genético dolor de punto de segunda generación importante de procesos, sistemas y algoritmos de optimización y heterogénea acelerados requisitos de ancho de banda IO nivel significativamente más bajo.

Al mismo tiempo, mejoran en gran medida la eficiencia de los análisis, la tecnología de Aurora también garantiza una excelente precisión de análisis y la precisión del análisis de software tradicional es consistente. Los investigadores analizaron los resultados obtenidos se calcularán en servidores de propósito general y sistemas heterogéneos Aurora, cargar el sitio web PrecisionFD Compare los resultados que se muestran en la Figura 2 y la Figura 3 a continuación:

Resultados de la prueba del procesador general

Resultados de la prueba del sistema heterogéneo Aurora

Cumplir con las necesidades de diferentes escenarios para ayudar a los clientes a generar el éxito empresarial

Tencent se basan en la nube y la rica experiencia acumulada en el campo de la computación en la nube, los grandes datos y la inteligencia artificial, la capacidad de cumplir con los diferentes escenarios y diferentes modos de necesidades de genes de los usuarios, por lo que es soluciones ecológicas bio-genéticos se ha convertido en un gran campo de ciencias de la vida del usuario prioridad. esto incluye la promesa Wo-inducidas fuentes de inteligencia, la nube de carbono, los genes Gezhi, Tencent nube, es promover el desarrollo de soluciones inteligentes para la industria de ciencias de la vida.

Estamos comprometidos con el campo de la investigación en ciencias biológicas y de la salud humana causados ​​por Novo Wo origen, utilice Tencent nube de supercomputación que coincida con precisión los recursos necesarios para cumplir con sus datos en diferentes escenarios de aplicación y modelos de investigación básica, aplicaciones de procesamiento de datos clínicos y genéticos, procesamiento, almacenamiento y la transmisión de los estrictos requisitos de personal para ayudar a científicos y médicos a centrarse más en la resolución de problemas científicos y clínicos.

nube de carbono inteligentes como compañía de ciencias de la innovación la vida, confiando en Tencent ventaja nube en el Internet y la inteligencia artificial, así como flexible, eficiente, de baja latencia de computación en línea y capacidades de procesamiento de datos que llevan grandes, incluyendo el establecimiento de un sistema de gestión de muestras biológicas, grandes sistemas de análisis de datos plataforma de computación, sistemas de gestión de datos de usuario, incluyendo la vida digital. el uso de análisis de inteligencia artificial, procesamiento de datos, la vida basada en el silicio-carbono en busca de un futuro, para ayudar a todos gestionar vida digital y la salud.

Diferente orden de magnitud de socios de negocios en el campo de la ciencia genética, Tencent nube se ha introducido productos rentables para satisfacer la demanda. Gezhi socio gen Huang Ke dijo que las máquinas virtuales entidad Blackstone Tencent nube ofrecen una combinación de soluciones de computación flexibles satisfacen el bajo costo Las necesidades informáticas de alto rendimiento, al proporcionar servicios de alta calidad en nuevos campos de ciencias de la vida, brindan a las empresas de nueva creación una gran solución.

Tencent nube se ha comprometido a ofrecer a los clientes soluciones líderes en la industria para ayudar a los clientes a resolver los cuellos de botella encontrados en el campo de la ciencia genética, Tencent nube representa el futuro va a introducir más servicios para reducir aún más los costes y mejorar el rendimiento general del gen del cliente. se entiende que Tencent nube Aurora FPGA aceleración se llevará a cabo a través de productos de doble hélice abierta, ha sido abierto a la experiencia cita para la prueba, se puede escanear el siguiente código de Fanger Wei para hacer una cita, mover experiencia más rápida, disfrutar de más beneficios.

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