première seconde génération programme accéléré FPGA de séquençage des gènes atterrissage nuage Tencent Chine

BEIJING, 25 décembre (Xinhua): Avec le développement rapide de la technologie de séquençage des gènes pour générer des données génétiques montrant une croissance exponentielle, des exigences plus élevées sur les capacités d'analyse récemment, lancé officiellement nuage Tencent première auto-développé la technologie Aurora à base de FPGA de la Chine. Programme d'accélération NGS pour améliorer considérablement l'efficacité de l'analyse du génome humain et améliorer efficacement le domaine de l'analyse des données génétiques est lente, inefficace et ainsi de suite.

Tencent cloud entièrement activé pour améliorer le domaine des problèmes génétiques

En tant que nouveau type de technologie de test génétique, le séquençage génétique joue un rôle très important dans la recherche en sciences de la vie: le développement rapide de l'industrie a entraîné une croissance explosive des données génétiques biogéniques. Récemment, Tencent Cloud a annoncé qu'elle libéraliserait totalement les diverses capacités informatiques et contribuerait au développement rapide et global des domaines des gènes en termes de transmission, de stockage, d'informatique, de gestion et de compréhension.

Tout d'abord, la valeur nominale des problèmes de transmission de données génétiques, nuage Tencent construire la ligne la plus complète 28 BGE environnement réseau qui permet aux clients de rapidement et de manière stable des données de téléchargement et télécharger gène, tout en aidant les clients à faire Cloud d'affaires sur les données génétiques, grâce à une clé Deuxièmement, le cloud Tencent répond aux différents besoins du domaine des applications de données et de la génétique en fournissant des services de stockage tels que le stockage de fichiers, le stockage d'objets et le stockage d'archives, et pour le plus Informatique, Tencent Cloud propose des services de super-cloud qui permettent aux chercheurs et aux fabricants de gènes de sélectionner une large gamme de machines virtuelles et de machines physiques hautes performances pour accélérer les calculs de gènes.

En outre, l'industrie des gènes cloud Tencent spécialement développé la plate-forme de gestion intégrée des données « double plate-forme PAAS hélice Tencent nuage », pour rencontrer le transfert de gènes des utilisateurs, le stockage, le calcul, les tuyaux et autres besoins. Il est entendu que la plate-forme de nuage Tencent a une double hélice trois caractéristiques. la première est l'analyse rapide de l'analyse génétique pour accélérer le processus en utilisant le FPGA sur la double hélice, pour le séquençage de deuxième génération, il peut déjà économiser 90% du temps, le suivi continuera d'accélérer l'introduction de trois générations de service, suivi par des économies de coûts, en se fondant sur des capacités de planification précises de la double hélice, double hélice sera prévue pendant les calculs nécessaires à l'exécution du groupe de travail considéré comme le meilleur match pour éviter beaucoup de CPU ou de la mémoire, la situation non transport. le troisième est la technologie habilitante de l'intelligence artificielle a été précis dans le domaine médical sol. par exemple, dans le Guangdong, AI Tencent demander de l'aide les médecins à faire l'ombre dans le dépistage du cancer de l'oesophage précoce, d'examiner l'impact d'une endoscopie, chercher l'ombre AI peut faire un diagnostic dans les 4 secondes, le taux de précision de 90%.

PAAS Internet schématique Tencent caractéristiques double hélice

NGS accélérer des programmes visant à améliorer l'analyse du génome humain de l'efficacité et la précision de l'analyse

Tencent a récemment lancé l'équipe de gènes en nuage depuis l'enquête FPGA Aurora systèmes hétérogènes NGS programme accéléré, vous pouvez optimiser l'ensemble de l'analyse du génome humain à partir de 30 heures à 2,8 heures. Au cours de l'expérience, les chercheurs ont utilisé une profondeur de séquençage de 30 fois l'humain génome fichier FASTQ (NA12878), sont courantes dans l'industrie en général est monté sur le serveur de haute performance et le système serveur sont hétérogènes test de comparaison FPGA Aurora, les données expérimentales montrent que le programme d'accélération Tencent NGS plus de 10 fois le taux d'accélération.

les systèmes informatiques classiques et des systèmes hétérogènes comparaison Tencent Aurora

Il est entendu que les systèmes informatiques traditionnels pour atteindre l'objectif de raccourcir le temps de construire par l'utilisation de plusieurs systèmes HPC CPU haut de gamme, mais il fait aussi l'augmentation des coûts, la taille des entreprises de gènes est limitée. Tencent Aurora systèmes hétérogènes tout en offrant des performances supérieures, mais aussi gène peut être encore réduit les coûts des clients, qui utilise la technologie de base auto-développé Aurora (Aurora technologie), l'optimisation de l'analyse et le calcul classique par les trois procédés suivants d'un seul tenant.

La première, portant BWA_MEM et Variant Appel coeur de l'algorithme de matériel dédié. Technologie de conception LSI de pointe, les performances de l'algorithme à un nouveau niveau.

Deuxièmement, l'optimisation au niveau de l'algorithme de l'accès à la mémoire.

Troisièmement, les goulots d'étranglement IO résultant des performances du système ne peuvent pas être améliorées a été une analyse génétique majeure de deuxième génération de point douloureux des processus, des systèmes et des algorithmes d'optimisation et accélération hétérogène niveau nettement inférieur besoins en bande passante IO.

En même temps, d'améliorer grandement l'efficacité de l'analyse, la technologie Aurora assure également une excellente précision de l'analyse et la précision de l'analyse des logiciels traditionnels est cohérente. Les chercheurs ont analysé les résultats obtenus seront calculés sur les serveurs à usage général et des systèmes hétérogènes Aurora, télécharger site PrecisionFD Comparez les résultats illustrés à la figure 2 et à la figure 3 ci-dessous:

Résultats du test général du processeur

Résultats du test du système hétérogène Aurora

Répondre aux besoins de différents scénarios pour aider les clients des gènes à réussir

Tencent compter sur un nuage et accumulé une riche expérience dans le domaine de l'informatique en nuage, les grandes données et l'intelligence artificielle, la capacité de répondre aux différents scénarios et différents modes de besoins des gènes des utilisateurs, ce qui en fait des solutions écologiques bio-génétiques est devenu un grand domaine des sciences de la vie utilisateur priorité. ce qui inclut la promesse de renseignement de nuage de carbone, les gènes Gezhi, nuage Tencent, Wo induites par les sources, est de promouvoir le développement de solutions intelligentes pour l'industrie des sciences de la vie.

Nous nous sommes engagés dans le domaine de la recherche en sciences de la vie et de la santé humaine causée par Novo Wo source, utilisez Tencent nuage de calcul intensif correspond précisément les ressources nécessaires pour répondre à ses données dans différents scénarios d'application et modèles de recherche de base, les applications de traitement de données cliniques et génétiques, le traitement, le stockage Et la transmission des exigences strictes pour aider la recherche scientifique et le personnel médical à se concentrer davantage sur des questions scientifiques et cliniques.

nuage de carbone intelligent société sciences de la vie de l'innovation, en se fondant sur l'avantage nuage Tencent dans l'Internet et de l'intelligence artificielle, ainsi que la souplesse, l'efficacité, l'informatique en ligne à faible latence et de grandes capacités principales de traitement de données, y compris la mise en place d'un système biologique de gestion des échantillons, grands systèmes informatiques de la plate-forme d'analyse de données, les systèmes de gestion des données de l'utilisateur, y compris la vie numérique. l'utilisation de l'analyse de l'intelligence artificielle, le traitement des données, la vie à base de carbone-silicium à la recherche pour l'avenir, pour aider tout le monde à gérer la vie numérique et la santé.

Ordre de grandeur différent de partenaires commerciaux dans le domaine de la science génétique, nuage Tencent a introduit des produits rentables pour répondre à la demande. Partenaire du gène Gezhi Huang Ke a déclaré que l'entité Blackstone machines virtuelles cloud Tencent offrent une combinaison de solutions informatiques flexibles répondent à faible coût a besoin de calcul haute performance, offrant des services de haute qualité dans le nouveau domaine des sciences de la vie, est une bonne solution pour les startups.

Tencent nuage a été engagé à fournir aux clients des solutions de pointe pour aider les clients à résoudre les goulots d'étranglement rencontrés dans le domaine de la science génétique, Tencent nuage représente l'avenir introduira plus de services afin de réduire davantage les coûts et améliorer la performance globale du gène du client. il est entendu que l'accélération Tencent nuage Aurora FPGA sera conduite par produit en double hélice ouverte, a été ouvert à l'expérience de test rendez-vous, vous pouvez scanner le code suivant Fanger Wei pour prendre rendez-vous, déplacer une expérience plus rapide, profiter d'autres avantages.

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