DeepVariant, инструмент для AI с открытым исходным кодом Google, развернут в Google Cloud Google
DeepVariant, инструмент, созданный Google Brain и Verily Life для повышения точности секвенирования генома, теперь доступен через облачную платформу Google (GCP), заложив основу для широкого внедрения DeepVariant.
По данным Healthcare IT News, команда разработчиков развернула версию DeepVariant с открытым исходным кодом на облачной платформе Google с расширяемым API Pipelines для оптимизации затрат и достижения быстрого поворота, что позволяет пользователям изучать и оценивать возможности DeepVariant в текущей вычислительной среде , Предоставляя облачное решение, которое удовлетворяет потребности огромного набора данных геномов.
DeepVariant рассматривает одну из самых больших проблем в прецизионной медицине сегодня благодаря точности высокопроизводительного секвенирования, разработчики DePristo и Poplin заявили, что только 100 генов в геноме 3-х пар оснований имеют базовую частоту ошибок 0,1 ~ 10%, все парные базы организованы в 23 пары хромосом.
Для создания DeepVariant команда Google Brain сначала начиналась с десятков миллионов примеров кодирования данных с высокой пропускной способностью, начиная с эталонного генома, организованного геномом в консорциуме бутылок (GIAB). Следующим шагом было обучение модели классификации Google TensorFlow, чтобы отличить истинные геномы И экспериментальные данные.
В 2016 году DeepVariant занял первое место в конкурсе PrecisionFDA Truth Challenge, спонсируемом Управлением по контролю за продуктами и лекарствами США (FDA), и с тех пор сократил коэффициент ошибок DeepVariant более чем на 50%.
Microsoft и Медицинский центр Университета Питтсбурга сотрудничают в разработке искусственного интеллекта (AI) и новых продуктов, которые включают в себя информацию о HealthVault, Microsoft Genomics, Chat Robot и Project InnerEye, чтобы создать лабораторию искусственного интеллекта для здравоохранения в Великобритании в сентябре 2017 года ,
С момента приобретения Phytel и Explories в 2015 году, IBM Watson сосредоточилась на ИА в области здравоохранения и добавила в портфель суперкомпьютеров Watson для Genomic и Watson for Oncology.
Цель Google - применить технологию к Medicare и другим научным приложениям, которые в конечном итоге делают инструменты и данные доступными для большего количества людей. DeepVariant использует вычислительную мощность и компьютерное обучение Google для понимания генома и более глубокого понимания сообщества Учебно-основанные инструменты геномики.