DeepVariant, ferramenta de AI médica de código aberto do Google, é implantada no Google Cloud Google
DeepVariant, uma ferramenta criada pelo Google Brain e Verily Life Sciences para melhorar a precisão do seqüenciamento do genoma, está agora disponível através do Google Cloud Platform (GCP), sentando as bases para a adoção generalizada do DeepVariant.
De acordo com a Healthcare IT News, a equipe de desenvolvimento implantou a versão open source do DeepVariant na Google Cloud Platform com uma API extensível de Pipelines para otimizar os custos e alcançar uma rápida reviravolta, permitindo que os usuários explorem e avaliem as capacidades do DeepVariant nos ambientes de computação atuais , Embora forneça uma solução em nuvem que atenda às necessidades de um enorme conjunto de dados de genomas.
DeepVariant aborda um dos maiores desafios em medicina de precisão hoje através da precisão do sequenciamento de alto rendimento, os desenvolvedores DePristo e Poplin disseram que apenas 100 genes no genoma do par de bases de 3 bilhões têm uma taxa de erro de base de 0,1 ~ 10%, todas as bases emparelhadas são organizadas em 23 pares de cromossomos.
Para construir o DeepVariant, a equipe do Google Brain começou pela primeira vez com dezenas de milhões de exemplos de codificação de dados de sequenciação de alto débito começando com o genoma de referência organizado pelo Genoma no Consórcio de Garrafas (GIAB). O próximo passo foi treinar o modelo de classificação Google TensorFlow para distinguir entre genomas verdadeiros E dados experimentais.
Em 2016, a DeepVariant assumiu o primeiro lugar no concurso PrecisionFDA Truth Challenge patrocinado pela US Food and Drug Administration (FDA) e reduziu a taxa de erro DeepVariant em mais de 50% desde então.
Microsoft e o Centro Médico da Universidade de Pittsburgh colaboram para desenvolver Inteligência Artificial (AI) e lançam novos produtos que incluem HealthVault Insights, Microsoft Genomics, Chat Robot e Project InnerEye para estabelecer um Laboratório de Inteligência Artificial para Saúde no Reino Unido em setembro de 2017 .
Desde a aquisição da Phytel e da Explorys em 2015, a IBM Watson concentrou-se na IA de saúde e adicionou o Watson para Genomic e Watson para Oncologia ao portfólio de supercomputadores.
O objetivo do Google é aplicar tecnologia ao Medicare e outras aplicações científicas que, em última análise, disponibilizem ferramentas e dados para mais pessoas. O DeepVariant aproveita o poder de computação e o aprendizado de máquina do Google para entender o genoma e fornecer uma visão mais profunda da comunidade Ferramentas de genômica baseadas na aprendizagem.